В Аллее художественными приемами через персоналии выдающихся военно-морских деятелей России представлены основные темы из истории российского флота. Структурно Аллея представляет собой «дорогу времени» — личности, через которых отражаются исторические темы, представлены в хронологической последовательности от прошлого к настоящему.

Военно-морские деятели представлены в 11 тематических зонах — специально оформленных нишах по обеим сторонам Аллеи. Стены и пол ниши содержат краткий рассказ о герое российского флота, исторической теме и её ключевых событиях через картины, географические карты, чертежи кораблей и схемы сражений, а также макеты артефактов, связанных с темой и героем.

Отдельная тематическая зона Аллеи — неперсонализированная. Она посвящена Военно-морскому флоту Российской Федерации на современном этапе развития и рассказывает о настоящем и будущем Балтийского, Северного, Тихоокеанского, Черноморского флотов и Каспийской флотилии России.

В каждой тематической зоне Аллеи достаточно места на целую экскурсионную группу или школьный класс.